|
|
Cirkulující nádorová DNA v moči a její využití jako potenciálního biomarkeru kolorektálního karcinomu
Surkovová, Veronika ; Ptáčková, Renata (vedoucí práce) ; Dračínská, Helena (oponent)
Kolorektální karcinom (CRC) je závažné onemocnění, jehož incidence v poslední době neustále narůstá. Pacienti, jejichž léčba je započata v raných stadiích nemoci mají vysokou šanci na vyléčení a kvalitní život. Se včasným odhalením nemoci, monitoringem stavu pacienta i vhodným určením diagnózy by mohla pomoci tzv. tekutá biopsie, při ní dochází k získání a analýze biomarkerů z různých tělních tekutin. Cílem této práce je izolace a analýza cirkulující nádorové DNA (ctDNA) z moči pacientů s pokročilým CRC, u kterých byla detekována ctDNA v plazmě. Pro analýzu je použita metoda založená na principu PCR s tvorbou heteroduplexů a následném rozdělení "wild type" a mutovaných fragmentů DNA pomocí denaturační kapilární elektroforézy. Na rozdíl od vzorků plazmy, přítomnost mutace KRAS ve vzorcích moči se nepotvrdila. Zavedený postup pro analýzu plazmy, snaha o nabohacení ctDNA tzv. přečištěním ani další testované izolační soupravy s využitím zvolené detekční metody neumožnily záchyt mutace KRAS v moči prostřednictvím ctDNA. Ačkoli se vyšetření ctDNA z moči obecně jeví jako nadějná metoda pro zlepšení úrovně léčby (kolorektálního) karcinomu, a ačkoli by její použití mohlo mít celou řadu výhod, je nutné této problematice věnovat ještě mnoho úsilí a času, než se stane rutinní záležitostí.
|
|
|
Dlouhodobé sledování hladin ctDNA u pacientů s metastatickým kolorektálním karcinomem pro včasný záchyt progrese či rekurence onemocnění
Kopalová, Dominika ; Benešová, Lucie (vedoucí práce) ; Kološtová, Katarína (oponent)
Cirkulující nádorová DNA (ctDNA) v periferní krvi pacientů s metastatickým kolorektálním karcinomem se jeví jako velmi slibný molekulárně-genetický marker, který poskytuje několik možných využití. Hladiny ctDNA kolísají v závislosti na přítomnosti a objemu nádorové masy (tumor burden) v těle pacienta, čehož se dá využít především pro včasný záchyt možné progrese, či rekurence onemocnění a při zhodnocení radikality operace, a to vše v rámci dlouhodobého sledování pacienta po operaci (tzv. follow-up). Díky minimální invazivitě vyšetření přítomnosti ctDNA z periferní krve (tzv. tekuté biopsie) je umožněno jeho opakované provádění v relativně krátkých časových intervalech. Z důvodu velmi nízkého zastoupení ctDNA v celkové volné DNA (cfDNA) v řádech jednotek až setin procent je stěžejním faktorem optimální metodika od izolace po dostatečně citlivou technologii detekce. V této diplomové práci se zabývám optimalizací izolačního procesu a analýzou ctDNA z nádorové tkáně a plazmy vybraných pacientů s metastatickým kolorektálním karcinomem v souvislosti s radikalitou operace a korelací s klinickým stavem pacienta.
|
|
|
Volná cirkulující DNA a její potenciál v onkologii
Karasová, Dominika ; Žižková, Hana (vedoucí práce) ; Novák, Josef (oponent)
Volná cirkulující DNA("cell-free DNA",cfDNA) je typ extracelulární DNA vyskytující se v krvi, která se v klinické praxi využívá v rámci prenatální diagnostiky. Velká pozornost je cfDNA věnována v souvislosti s nádorovými onemocněními, kde se ukazuje její velký potenciál pro využití v onkologii, ve které se nejčastěji využívá volná cirkulující tumorová DNA. Vhodnou alternativou klasické biopsie, která je bezpečnější, méně bolestivá pro pacienta a zachycuje heterogenitu nádoru je tzv. tekutá biopsie, kterou lze volnou cirkulující DNA získat z krve. Ve většině studií se ukazuje, že cfDNA poskytuje stejné informace jako tkáňová DNA, ať už se jedná o genetické či epigenetické změny detekované v nádorových buňkách a v některých případech umožnila citlivější nebo časnější detekci relapsu onemocnění v porovnání s rutinně používanými vyšetřeními. Vysoká specifita i citlivost tohoto neinvazivního přístupu tak mohou být pro pacienty velikým přínosem. Nicméně, pro potvrzení jejího diagnostického a prognostického významu je však třeba rozšířit soubory pacientů s jednotlivými diagnózami a nejen pro porovnání dat i standardizovat metody izolace a detekce cfDNA. Cílem této práce je získat všeobecný přehled o volné cirkulující DNA a jejím potenciálním využití v onkologii. Klíčová slova: volná cirkulující DNA, volná...
|
host ::
RSS.